Inició su existencia afectiva en el Valle de Abdalajis (Málaga). El año 1873 al recoger al primer grupo de ancianos abandonados del pueblo, en una casa alquilada de la calle Alameda. Al principio eran Josefita y Ana Josefa (Madre Petra de San José). En Abril de 1876, fueron a Málaga y en la capital conocieron al Sr. Provisor Don Juan Nepomuceno Zegrí que estaba fundando la Congregación de las Mercedarias de la Caridad. Más tarde se les unieron otras compañeras y en 1877 a la muerte del padre de Ana, el 11 de enero, extendieron su apostolado hasta el pueblo próximo: ALORA. El 1878 el 2 de noviembre ingresó y tomó el hábito, Ana, en la Congregación de las Mercedarias. Sus compañeras el 6 de enero de 1879. El 24 de septiembre de 1879 dejaron la Congregación Mercedaria. En la Navidad de 1880, nació afectivamente la Congregación en Vélez-Málaga, así lo comunicó a Ana el Obispo de Málaga, el Dr. Gómez Salazar y le dio el nombre de: MADRES DE DESAMPARADOS. Las cinco primeras religiosas a la cabeza Madre Petra, tomaron el hábito y profesión, el 2 de febrero de 1881. APROBACIÓN DIOCESANA. Nacimiento efectivo de la Congregación Madres de Desamparados. En 1891 el 17 de julio el Papa León XIII dio el «DECRETO DE ALABANZA» APROBACION APOSTÓLICA. El 30 de junio de 1908 S.S. Pío X aprobó el Instituto con el Documento Pontificio. «Caritativo Instituto de Madres de Desamparados». En el año 1934, adaptadas las Constituciones a las normas canónicas, fueron aprobadas por siete años. (El 14 de febrero por S.S. Pío XI). Por fin el 14 de junio de 1958, S.S. Pío XII, APROBÓ DEFINITIVAMENTE LAS CONSTITUCIONES.

Aprobaciones Civiles

• El 15 de febrero de 1898: 
  Reconocimiento Jurídico. 
  Real Orden del Ministerio de Gracia y Justicia.
  Fue publicado en «La Gaceta» el 28 de diciembre de 1898.
• 22 de julio de 1926: 
  Reconocimiento Civil;
  Real Orden Ministerial